Управление Учреждением осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности в соответствии с. ч.2. ст. 26 Федерального закона РФ от 29.12.2012 № 273 – ФЗ «Об образовании в РФ».
Единоличным исполнительным органом МОУ "Пристанционная СОШ" является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью школы.
Коллегиальными органами управления Учреждением являются: педагогический совет, Совет школы. а также в Учреждении функционирует общее собрание членов трудового коллектива МОУ "Пристанционная СОШ".
Структура, порядок формирования, срок полномочий и компетенция органов управления школой, порядок принятия ими решений и выступления от имени школы устанавливаются уставом.